С 1783 по 1786 годы игумен Аполлос был настоятелем Заиконоспасского монастыря и ректором находившейся там Московской Духовной Академии.
В 1786 году назначен настоятелем Воскресенского, Новый Иерусалим именуемого, монастыря.
5 июня 1788 года рукоположен во епископа Орловского. С 1798 года - епископ Архангельский и Холмогорский. Скончался 14 мая 1801 года.
Епископ Аполлос был членом Академии Наук, автором трудов по теории русской словесности, из которых «Правила поэтические» и «Грамматика славяно-русского языка» использовались как учебные пособия в духовных училищах.
Из других трудов епископа Аполлоса известны «Богословские рассуждения» (М., 1781), «Натура и благодать» (М., 1784); из неизданных - «Историческое описание Воскресенского монастыря» (рукопись хранится в Российском государственном архиве древних актов).